A falha no tratamento endodôntico pode ser causada pela permanência de micro-organismos resistentes no sistema de canais radiculares como o Enterococcus faecalis. A adesão bacteriana aos biomateriais é um processo complexo e influenciado por vários fatores relacionados ao tipo de bactéria, superfície e microambiente. Dentre os biomateriais amplamente utilizados na Odontologia podemos destacar a guta-percha utilizada como material de preenchimento durante a obturação do sistema de canais radiculares. Neste sentido avaliar e quantificar o processo de adesão de bactérias em superfícies de interesse endodôntico, além de aprofundar o conhecimento acerca dos mecanismos de adesão, pode auxiliar no aprimoramento de protocolos clínicos. Técnicas recentes baseadas no uso da microscopia de força atômica (MFA) vem sendo empregadas de maneira exitosa em microbiologia e se consolidando como uma poderosa ferramenta para investigar a adesão bacteriana. Assim, este trabalho apresenta uma análise preliminar da morfologia da bactéria Enterococcus faecalis aderida a superfície da guta-percha (cones e discos) por meio da técnica de MFA. Os resultados obtidos apontam que as características topográficas da superfície influenciam nas dimensões morfológicas do Enterococcus faecalis aderidos a superfícies.