Conferências do IFSP, 12º CONGRESSO DE INOVAÇÃO, CIÊNCIA E TECNOLOGIA DO IFSP

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ANÁLISE DA REDE DE INTERAÇÃO DE PROTEÍNAS DA BACTÉRIA KLEBSIELLA PNEUMONIAE USANDO METIDAS DE CENTRALIDADE
Gabriel Fernandes Justino, Rodrigo Henrique Ramos

Última alteração: 2021-10-04

Resumo


Com os avanços nas tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração houve um aumento significativo na disponibilização de dados ômicos. As Rede de Interação de Proteínas modelam as interações celulares e podem ser utilizadas para analisar características genômicas dos organismos modelados. A base de dados STRING disponibiliza a rede de vários organismos, dentre eles o da bactéria Klebsiella Pneumoniae. Essa bactéria é resistente à maioria dos antibióticos e causa sérios problemas nos infectados. Partindo da hipótese de que a rede de interação de proteínas dessa bactéria tem características particulares, foi realizado uma análise usando as medidas de centralidade Grau, Closeness e Betweenness. A distribuição de Grau e de Betweenness teve o comportamento esperado para redes livres de escala. O Closeness apresentou valores próximos de zero em cerca de 40% dos vértices e um comportamento linear nos demais. Os valores do Closeness indicam a existência de vários vértices periféricos que se conectam apenas com vizinhos próximos. Essa descoberta levanta a possibilidade de outras análises que consideram a distância entre vértices, assim como a comparação com as redes de outras bactérias.


Palavras-chave


dados ômicos; rede de interação de proteínas; redes complexas; medidas de centralidade; klebsiella pneumoniae.

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